Tuy nhiên do công tác lưu trữ hồ sơ những năm trước đây chưa được thực hiện tốt, một số xã thuộc vùng sâu, vùng xa tỉnh Hà Tĩnh có điều kiện kinh tế - xã hội khó khăn, cơ sở vật chất, trang thiết bị phục vụ cho công tác lưu lập hồ sơ thiếu thốn, lạc hậu, thường xuyên phải hứng chịu những trận lũ lụt nên hồ sơ 299 đã bị mất mát, hư hỏng...
Do vậy, hiện nay, các hộ đang sử dụng thửa đất ổn định từ trước năm 1980 đến nay, không có tranh chấp, nộp thuế nhà đất và thực hiện các nghĩa vụ đối Nhà nước đầy đủ; khi thực hiện cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất hoặc công nhận đất ở để thực hiện chính sách bồi thường, hỗ trợ khi Nhà nước thu hồi đất cho các hộ gia đình, cá nhân sử dụng đất trước ngày 18/12/1980 không được áp dụng theo quy định trên mà phải áp dụng theo quy định tại khoản 5 Điều 87 Luật Đất đai năm 2003 và Điều 14 Nghị định số 84/2007/NĐ-CP ngày 25/5/2007.
Nhưng UBND tỉnh Hà Tĩnh cho biết, trong quá trình thực hiện cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất, đặc biệt thực hiện chính sách bồi thường, hỗ trợ tái định cư, giải phóng mặt bằng, nhân dân không đồng ý và cho rằng khi thực hiện Chỉ thị 299/TTg, người dân đã hoàn thành việc kê khai đăng ký ruộng theo quy định, hiện nay không có hồ sơ 299 không phải là lỗi của người dân.
Để đảm bảo sự công bằng với các hộ gia đình, cá nhân sử dụng đất cùng thời điểm, UBND tỉnh Hà Tĩnh đã đề nghị Thủ tướng Chính phủ chấp thuận cho Tỉnh được áp dụng quy định tại điểm b khoản 1 Điều 50 và khoản 2 Điều 87 Luật Đất đai năm 2003 để công nhận đất ở cho hộ gia đình, cá nhân đối với các trường hợp sử dụng đất trước ngày 18/12/1980, hiện đang sử dụng ổn định, có ranh giới rõ ràng, không có tranh chấp, đã kê khai đăng ký ruộng theo Chỉ thị 299/TTG nhưng hiện nay không còn hồ sơ 299.
Kết luận về vấn đề này, Thủ tướng Chính phủ đã đồng ý về nguyên tắc với đề nghị trên của UBND tỉnh Hà Tĩnh.
Quốc Hà
3 
